O Santos foi bicampeão da Copa São Paulo de futebol júnior, ao derrotar o Goiás por 3 a 1, dia 25 de janeiro de 2013. O primeiro título do Santos na competição aconteceu em 1984. Entre os nomes do time campeão aparecem Neilton (clone de Neymar), o atacante Giva, os zagueiros Wallace e Jubel.